Biología Molecular

Existe gran cantidad de datos genómicos existentes para el patógeno respiratorio  Streptococcus pneumoniae   permitiendo el diseño de un microarray de proteoma con  más de 2,000 proteínas neumocócicas y 208 anticuerpos fuertemente unidos en sueros humanos adultos. El estudio r eveló una distribución continua de afinidades de IgG por 2,190 antígenos potenciales del pangenoma de toda la especie,  incluyeron 109 variantes de las diversas proteínas de superficie neumocócica A y C y las metaloproteasas de zinc A y B, generando una unión a IgG reproducible. Se conocieron  que algunos antígenos variables se diversificaron rápidamente a través de mecanismos que incluyen la recombinación homóloga, la transmisión de elementos genéticos móviles y la variación de fase.  Otros antígenos se conservaron en toda la población y pueden ser mejores candidatos para formulaciones de vacunas simples. . Referencia Bibliográfica 1 .   Nicholas J. Croucher ,  Joseph J. Ca...

Tema:  Detección y predicción de  serotipos  de  Streptococcus pneumoniae  directamente de hisopos nasofaríngeos mediante PCR Objetivo: Evaluar  la viabilidad de la detección basada en PCR y el serotipado de neumococos directamente en hisopos nasofaríngeos (NP) recolectados de forma rutinaria para estudios virales para agregar al repertorio de métodos sin cultivo utilizados para la vigilancia neumocócica. Muestra:  esputo y sangre  Acido Nucleico: ADN genómico Genes:   lytA  y  cpsA Tipo de PCR:  cmPCR y  rmPCR Pasos:  - Desnaturalización:   95 ° C durante 90 s - Hibridación:   95 ° C durante 30 s - Extensión :  54 ° C durante 90 s - Extensión final:   72 ° C durante 10 min Sensibilidad:  10 veces en PBS de varios  S. pneumoniae   Especificidad :  95%  Visualización: Electroforesis en gel de agarosa al 1,2 % (p/v) con bromuro de etidio        Figura 1:...

La metilación del ADN es un mecanismo epigenético importante para la diversificación fenotípica en todas las formas de vida. En el caso del  Streptococcus pneumoniae  es un patógeno humano líder y su  diversidad epigenética es causada por extensas inversiones de ADN entre  las HSD A,   HSD B,  y  HSD C , tres metiltransferasa  HSD, en donde   hsdS  A  codifica la subunidad de reconocimiento de secuencia de esta metiltransferasa de ADN RM tipo I, estas recombinaciones específicas del sitio generan células neumocócicas con  alelos  HsdS A  variables  y, por lo tanto, diversos patrones de metilación del genoma.  Referencias Bibliográficas 1. Jing Li, Jing Wen Li, Zhixing Fen, Haoran An, Yanni Liu, Robert Sebra y Guilin Wang.  Epigenetic Switch Driven by DNA Inversions Dictates Phase Variation in  Streptococcus pneumoniae. [Internet]  National Center of Biotechnology 2016. Disponibl...

Se encuentra la presencia de un  ARN mensajero de transferencia (ARNm), codificado por el  gen  ssrA  que es un pequeño ARN no codificante implicado en  la trans- traducción cuyo proceso se complementa con la proteina SmpB,   que contribuye al reciclaje de los ribosomas estancados en los ARNm aberrantes. S u inactivación se ha relacionado con una capacidad disminuida para responder y recuperarse de una variedad de condiciones de estrés ademas de reducir su tasa de crecimiento.   Referencias Bibliográficas 1. Liliana Brito, Joana Wilton; María J. Ferrándiz, Alicia Gómez, Adela de la Campa y Mónica Amblar.  Absence of tmRNA Has a Protective Effect against Fluoroquinolones in  S treptococcus pneumoniae. [Internet] National Center of Biotechnology 2017. Disponible en:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5222879/#B60